Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ercc8Q8CFD5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ercc8Q8CFD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ercc8Q8CFD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ercc8Q8CFD5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Ercc8Q8CFD5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ercc8Q8CFD5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ercc8Q8CFD5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ercc8Q8CFD5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ercc8Q8CFD5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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