Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Colec10Q8CF98 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Colec10Q8CF98 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Colec10Q8CF98 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Colec10Q8CF98 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms