Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp27Q8CEG8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp27Q8CEG8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp27Q8CEG8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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