Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc63Q8CDV6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms