Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q8CDS7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8CDS7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8CDS7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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