Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc9Q8CDN9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc9Q8CDN9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms