Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCT7

Nsun3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsun3Q8CCT7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsun3Q8CCT7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Nsun3Q8CCT7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Nsun3Q8CCT7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nsun3Q8CCT7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nsun3Q8CCT7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nsun3Q8CCT7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nsun3Q8CCT7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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