Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nhlrc3Q8CCH2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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