Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nhsl1Q8CAF4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nhsl1Q8CAF4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms