Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Atg4aQ8C9S8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Atg4aQ8C9S8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atg4aQ8C9S8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Atg4aQ8C9S8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Atg4aQ8C9S8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atg4aQ8C9S8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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Atg4aQ8C9S8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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