Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spef2Q8C9J3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Spef2Q8C9J3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms