Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8C708 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8C708 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q8C708 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8C708 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8C708 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8C708 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8C708 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8C708 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q8C708 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q8C708 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q8C708 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms