Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sfrp1Q8C4U3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sfrp1Q8C4U3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms