Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsfm13Q8BXS2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms