Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Iffo1Q8BXL9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Iffo1Q8BXL9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms