Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Actrt3Q8BXF8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Actrt3Q8BXF8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms