Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ctdsp2Q8BX07 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ctdsp2Q8BX07 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ctdsp2Q8BX07 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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