Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lmod1Q8BVA4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lmod1Q8BVA4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms