Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cfap20Q8BTU1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cfap20Q8BTU1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms