Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup54Q8BTS4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup54Q8BTS4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms