Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ap3s2Q8BSZ2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms