Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tyw3Q8BSA9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tyw3Q8BSA9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms