Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem260Q8BMD6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem260Q8BMD6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms