Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLI4

Dse, Dermatan-sulfate epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DseQ8BLI4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DseQ8BLI4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DseQ8BLI4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms