Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp54Q8BL06 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Usp54Q8BL06 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms