Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnrc6bQ8BKI2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnrc6bQ8BKI2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.9 ms