Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nop53Q8BK35 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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