Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rspo4Q8BJ73 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rspo4Q8BJ73 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms