Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH97

Rcn3, Reticulocalbin-3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn3Q8BH97 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rcn3Q8BH97 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rcn3Q8BH97 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms