Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atg4dQ8BGV9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg4dQ8BGV9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms