Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrtm2Q8BGA3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm2Q8BGA3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms