Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Katnb1Q8BG40 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Katnb1Q8BG40 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms