Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG07

Pld4, Phospholipase D4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pld4Q8BG07 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pld4Q8BG07 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pld4Q8BG07 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms