Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Srgap3Q812A2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srgap3Q812A2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms