Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc50Q810U5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms