Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ChfrQ810L3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ChfrQ810L3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms