Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim19Q80ZU4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms