Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b3Q80ZS5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b3Q80ZS5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cldn34b3Q80ZS5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cldn34b3Q80ZS5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cldn34b3Q80ZS5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Cldn34b3Q80ZS5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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