Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ7

Snx32, Sorting nexin-32, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx32Q80ZJ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Snx32Q80ZJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx32Q80ZJ7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms