Protein–RNA interactions for Protein: Q80YF6

Upk3b, Uroplakin-3b, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3bQ80YF6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Upk3bQ80YF6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Upk3bQ80YF6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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