Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef17Q80U35 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Arhgef17Q80U35 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arhgef17Q80U35 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arhgef17Q80U35 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Arhgef17Q80U35 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Arhgef17Q80U35 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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