Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klhl29Q80T74 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Klhl29Q80T74 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms