Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg1cQ7TSF0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1cQ7TSF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms