Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clec4b1Q7TS58 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clec4b1Q7TS58 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms