Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RgmbQ7TQ33 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RgmbQ7TQ33 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms