Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Mycbp2Q7TPH6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mycbp2Q7TPH6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms