Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TwistnbQ78WZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms