Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SynmQ70IV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SynmQ70IV5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SynmQ70IV5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms