Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ7

Spcs3, Signal peptidase complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs3Q6ZWQ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Spcs3Q6ZWQ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms