Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nup188Q6ZQH8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup188Q6ZQH8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms